unidata 等よりソースファイル netcdf.tar.Z 等を入手
豊田さんのパッチの必要部分を netcdf-3.4-patch として別途保存

$ tar zxfv netcdf.tar.Z
$ cd netcdf-3.5.0/src

$ patch -p1 < ../../netcdf-3.4-patch

$ CC=icc FC=ifort F90= CXX=icc ./configure --prefix=/usr/local/netcdf-ifc

$ su
# make
# mkdir /usr/local/netcdf-ifc
# make install

# cd ../bin
# ln -s /usr/local/netcdf-ifc/bn/* ./

使用例

$ ifort hoge.f -o hoge -I/usr/local/netcdf-ifc/include -lnetcdf -L/usr/local/netcdf-ifort/lib

*** for Fujitsu Fortran ***

$ CC=fcc FC=frt F90= CXX=FCC ./configure --prefix=/usr/local/netcdf-frt

Intel だと C++ 失敗、Fujitsu だと F90 失敗するみたい。
とりあえず Fortran のライブラリーが出来ればいいか。